Komisariat Fakultas Syariah merupakan salah satu komisariat dari organisasi mahasiswa yaitu HMI terkhusus cabang Jayapura di kampus IAIN Fattahul Muluk Papua yang diketuai oleh Abang Ridho Febrian Bagunis.
Komisariat ini memegang 1 fakultas dan 3 jurusan dalam kampus IAIN Fattahul Muluk Papua, yaitu Fakultas Syariah dengan prodi Hukum Tata Negara, Hukum Ekonomi Syariah dan Hukum KEluarga Islam
